时，亚齐继续对外扩张，发展海上贸易、组建舰队，多次击败葡萄牙殖民者的进犯，并先后压制了阿鲁和柔佛两国。
1547年，亚齐对葡萄牙人发动凌厉攻势，击败了葡萄牙人。1564年，亚齐进攻柔佛王国，俘虏了柔佛王国的苏丹，毁灭了柔佛城。
1568年，亚齐攻打马六甲，但这一次他们遭到了惨败。1569年，不甘失败的亚齐计划突袭马六甲城，然而时也势也，此时的葡萄牙战船武备已经今非昔比。
此战之中，号称多达200艘的亚齐船队围攻一艘葡萄牙卡拉克帆船而不下，颜面大失、士气大跌，最后由于实力确实不足，亚齐只得被迫放弃突袭计划。
痛定思痛之后，到了尹斯坎达尔·穆达执政时期，亚齐国力达到鼎盛，遂再次与葡萄牙人斗争，多次进攻葡萄牙殖民者占领的马六甲城。
后虽然未能占领马六甲，但是却顺带征服了马六甲附近的彭亨岛、吉打岛、霹雳岛、尼亚斯岛及英达腊普腊，于是其版图除北苏门答腊外，还占据马来半岛的一些地区，直到京华大军自暹罗南下为止。(注：但原历史上亚齐还能存活很久。)
换句话说，这里有几点值得注意：
其一，亚齐本与葡萄牙是宿敌，双方打了差不多八十年了，相互之间的关系可谓势不两立；其二，亚齐王国此时几乎出于鼎盛时期，以至于能拿下马六甲城周边的一些地区……由此就引出其三、其四。
其三，京华拿下这些地区的时候，是按照该地区属于葡萄牙殖民地的属性拿的，因为从某种“契约法理”而言，亚齐占领这些地区的时候与葡萄牙没有达成过和约，而之前葡萄牙拿下这些地方的时候，倒是逼迫其对手签字画押过的。
由此，京华通过与葡萄牙的协定拿下这些地区，在京华来看完全占理，而在亚齐来看，却认为是京华入侵他们了。
其四，京华与葡萄牙达成的协议除了通航换领土，还有贸易协定。比如说《协定》约定，缔约各方互为贸易最惠国，关税及海关税按照详细约定，维持在5%-15%之间，其中最高税率15%仅限于奢侈品关税。
考虑到“六国集团”方面很多时候其实只是在做京华的白手套，而京华的货物之中来自于大明的丝绸与瓷器仍然占据相当份额。
这两类产品都是被归纳为奢侈品的，故葡萄牙方面理论上获利更大，因此双方另外约定，葡萄牙王国开放其在印度的诸据点准许京华船只使用，使用过程中一切权利按照葡萄牙王国本国
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