加积极对抗奥斯曼帝国，整个地中海的局势发生了扭转。
但高务实知道，事情并不是那么简单，因为实际上在仅仅一个冬季过后，奥斯曼帝国就重建了海上势力，战船数量有增无减。奥斯曼帝国上至苏丹，下至百姓，都认为他们在勒班陀战役中只是“失去了胡子”，并没有受到任何致命打击，帝国的根基丝毫没有动摇。
这场战役，奥斯曼帝国肯定没有赢，但也的确谈不上输。
此时的西班牙国王腓力二世已经拖欠了大量债务，他的注意力也被分散到西方和北方——征服信奉天主教的葡萄牙和正在提议中的对新教英格兰的入侵。他与土耳其的和约确认将在地中海上在***和基督教世界之间设置一条固定的疆界。
占领塞浦路斯之后，奥斯曼土耳其人几乎已经完全控制了地中海东部，尽管克里特还在威尼斯控制下。然而马耳他战役的失败和勒班陀的灾难打破了奥斯曼帝国进军罗马的希望。突尼斯被土耳其收复后，西班牙清楚地认识到，北非已经稳稳当当地成了奥斯曼帝国的一部分，查理五世的征服君士坦丁堡的梦想早已是昨日黄花。
代表两大宗教的两个海军强国至此打成了僵局。
奥斯曼只是没有赢罢了，但也谈不上什么损失，可假如基督教世界没能赢得勒班陀战役，就必然会把整个地中海都输掉。
战役结束一年之后，年迈的堂加西亚·德·托莱多，还在为勒班陀战役的巨大风险而面色煞白；堂·胡安在那场战役中着实是孤注一掷；堂·加西亚知道，假如战役失败，将给基督教地中海的海岸地区带来灾难，尽管战役的结局很辉煌，但胜利实在是侥幸所致。
如果战役失败，又没了可供防御作战的舰队，地中海的所有主要岛屿——马耳他、克里特、巴利阿里群岛都将迅速落入敌手，这些岛屿是威尼斯的最后一道防线；然后土耳其人就能够以这些岛屿为跳板，进攻意大利腹地，一直打到罗马，也就是苏莱曼的最终目标。
如果舒鲁奇·穆罕默德成功地消灭了威尼斯那一翼；如果重武装的加莱赛战船没能打乱阿里帕夏的中军；如果还乌卢奇·阿里能够早一个小时穿透多里亚的战线……整个南欧的版图将与今天大相径庭。
马耳他战役对奥斯曼人的遏制和勒班陀的胜利，阻断了奥斯曼帝国在地中海中心的扩张。
而对拿下君士坦丁堡再也不抱希望的西班牙殖民帝国，却将目光转向了东方。
在不久的将来，西班牙与葡萄牙两大先驱级殖民帝国就
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